在污水处理全过程中应留意是不是会导致二次污染。例如，制药厂的废水中含有大量的有机物（如苯、、等），能够在曝气过程中排放，影响环境大气环境；化肥厂的废水经过沉淀和冷却解决后再循环利用，能够在冷却塔尾气中含有物，对大气造成污染；厂的废水选用碱法解决，如果用石灰作为碱剂，则会造成二次污染；印染厂的废水处理将是主要考虑到的问题。
总的来说，污水处理工艺的挑选应整体考虑到多种要素，对各种方案开展技术经济对比。
印染废水指的是关键以化学纤维、加工棉、麻等主导的印染厂排出来的废水，通常情况下具备有机污染物浓度高、深，能够使PH值变化大等特点，而印染废水处理的意义关键在于去除废水中存有的各种各样有害物质，预防自然环境遭受污染，让水做到再度运用。如今，运用在印染废水处理工艺主要是以物理化学和生物法主导。
印染废水处理通常要历经二级处理，其出水量水质仍没法做到排放量及其回用规范的标准，关键在于当中带有残余的CODCr，归属于难生化降解有机物，必须开展处理，现阶段的处理技术加工工艺还有物理法、氧化法、生物法等。
化工工业废水具有多样性，对于水体的污染情况也具有不同的特点。一般来说经过污染的水体颜色会加深水中的生物数量将会减少，水体可能出现发臭的情况，水面上会长期出现悬浮固体物质，一部分有毒化合物在自然环境中是不能自然分解的，这些物质在自然环境中可以存在很长的时间，对周围的自然生态环境造成持久性的破坏，而且随着地下水系的拓展，其污染的范围将会持续扩大，针对此类型的污染环境，必须要抓住并控制其影响范围，在很短的时间内采取有效手段对其进行解决，否则将会影响到极大的范围，造成巨额的经济损失和社会影响。
电镀废水分类不合理。随着现代电镀行业中各种新技术、新工艺、新材料的运用，电镀废水中的污染物也变得越来越复杂。国内有关电镀行业的文献指出，电镀废水少则分为3~5类，多达数十类。电镀废水分类不清晰、不合理,导致电镀废水治理与回用的难度加大、成本上升。
电镀废水治理回用率不高。在清洁生产的带动下，电镀废水的回用率已经有了大幅提升，特别是膜处理、纳滤、离子交换等新技术的应用提高了电镀废水的处理水平。但整体而言，我国电镀废水的回用率并不高，尤其是对电镀废水中有机物的处理效果不理想。尽管现代电镀废水治理回用技术对金属离子的处理效果已有了长足的进步，但废水治理回用装置的稳定性较差，难以满足工业化排污标准的要求。